Il terminal di Giovinazzo vanta un’area totale di 30.000  m² , 10.000 m² dei quali di deposito scoperto. Inoltre il terminal dispone di 15.000 m² di capannoni (non raccordati).

Struttura ferroviaria
Il terminal possiede un totale di 4 binari, di cui 3 operativi e 1 di stoccaggio treni. La lunghezza minima dei binari è di 350 metri, mentre quella massima è di 750 metri.